Las aplicaciones de dinámica molecular se ejecutan a la perfección en la arquitectura masiva paralela de las GPU de NVIDIA. En los gráficos que aparecen más adelante, destacamos el trabajo realizado en VMD así como los paquetes de software de dinámica molecular tales como NAMD y HOOMD.

Colocación de iones en VMD Stone, Phillips, Hardy, Schulten	HOOMD en 1 GPU NVIDIA supera el rendimiento de 16 núcleos de CPU ejecutando LAMMP Anderson, Lorenz, Travesset

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